Autres analyses

Expert en génétique animale, retrouvez ci-dessous les analyses réalisées par notre laboratoire Aveyron Labo en génomique bovine et la génomique ovine. N’hésitez pas à nous contacter pour plus de renseignements.

Notre plateforme de génotypage et notre service de R&D dédié nous permet de proposer des prestations de service adaptées à vos besoins. Agréé par le ministère en charge de la Recherche pour le CIR, une partie de vos travaux de R&D réalisés en sous-traitance sont déduits des impôts.

Notre offre de Génomique bovine

Gène Culard bovin (Mh)

Le gène Mh codant pour la myostatine, agit normalement en inhibant la croissance musculaire. Des mutations sur ce gène peuvent avoir pour conséquence une hypertrophie musculaire.

Neuf mutations sont connues pour avoir une influence plus ou moins importante sur le développement musculaire des bovins.

La connaissance de ces mutations est un élément important et un outil supplémentaire pour aider à la production et à la valorisation des animaux dans les différentes races bovines.

Gène sans corne Celtique & Gène sans corne Frisonne

Le caractère sans corne des bovins est connu depuis des millénaires, mais il a fallu plus de vingt ans pour déterminer les mutations responsables de ce phénotype :

Sur les races bovines européennes, deux types de mutations sont connues, la mutation celtique et la mutation frisonne. Pour ces deux mutations, le caractère « polled », c’est-à-dire sans corne est dominant, cela signifie qu’un animal au phénotype sans corne peut être hétérozygote ou homozygote.

L’analyse permettra de confirmer le nombre d’allèles et d’optimiser les croisements selon les objectifs recherchés.

Free Martinisme

Depuis plusieurs siècles, il a été observé que la plupart des génisses jumelles d’un veau mâle sont stériles. Cette anomalie appelée free martinisme est liée aux connexions établies précocement entre les placentas des jumeaux, elle peut se traduire par des anomalies visibles de l’appareil génital femelle (masculinisation) mais peut aussi ne pas s’exprimer sur l’anatomie de la génisse et malgré tout aboutir à la stérilité. La probabilité d’avoir une femelle dite « free martin » et par conséquent stérile, est élevée lors de gestation gémellaire hétérosexuée.

Le diagnostic précoce trouve donc son intérêt, lors de vente ou de souhait de conservation de la génisse pour la reproduction. Les animaux free martin présentent un degré de chimérisme variable.

Aveyron Labo a mis en place un test de dépistage PCR permettant le diagnostic du free martinisme dès le plus jeune âge.

Puce Illumina EuroG MD

Aveyron Labo fait partie des laboratoires de génotypages ayant accès à la puce à ADN EuroG MD du consortium européen EuroGenomics.

Ainsi, tous les marqueurs utiles en sélection génomique ainsi qu’une sélection de marqueurs permettant de déterminer les statuts des anomalies génétiques et gènes d’intérêt sont présents sur cette nouvelle puce de génotypage.

Son utilisation permet de réaliser l’identification génétique des animaux ainsi que l’analyse de mutations causales d’intérêt.

Elle est constituée de deux parties :

Une publique dans laquelle Aveyron Labo peut extraire directement les données (Mh, Ataxie, …).
Une privée, accessible à Aveyron Labo par l’intermédiaire de Valogène

L’ensemble du screening génétique peut également être transmis à Valogène pour calcul d’index via les licences GEMBAL ou G2R.

Puce Illumina 54 K, LD

D’autres puces Illumina de haute ou moyenne densité sont proposées pour des études spécifiques, des recherches de mutations causales, des calculs d’index…

Aveyron Labo peut analyser n’importe quelle puce à ADN de la technologie Illumina. N’hésitez pas à nous contacter pour plus de détails.

Notre offre de Génomique ovine

Assignation de parenté (Panel SNP Ovin)

L’assignation de parenté s’appuie sur l’analyse d’un panel de marqueurs SNP validé par l’INRA et l’institut de l’élevage.

Les données de filiation, issues de l’analyse de ce panel sont transmises et exploitées par l’institut de l’élevage et les organismes de sélection pour améliorer la gestion des schémas de sélection.

Génotypage Tremblante Ovine (PrP)

Les mutations du gène PrP agissent sur la sensibilité de l’animal à la tremblante ovine.

Le génotypage sur 3 ou 4 codons permet la gestion de la sensibilité à la tremblante.

Les résultats font l’objet d’un envoi au CTIG (Centre de Traitement de l’Information Génétique).

Gène Culard Texel

La mutation associée à l’hypertrophie musculaire bien connue dans la race Texel Belge a été mise en évidence dans une région non transcrite du gène GDF8 (Myostatine).

La myostatine a pour effet d’inhiber la prolifération des cellules musculaires. Le blocage de ce gène aura pour conséquence une hypertrophie des muscles, une diminution de la teneur en graisse et en collagène.

Les résultats font l’objet d’un envoi au CTIG (Centre de Traitement de l’Information Génétique).

Hyper prolificité ovine - Gènes FecL, Booroola (FecB), BMP15 Lacaune & BMP15 Grivette

Chez les ovins, on constate des variations importantes du nombre d’agneaux par mise-bas. Parmi les principales mutations décrites comme ayant une action sur le taux d’ovulation, le FecL et le FecB (Booroola) sont des mutations majeures chez certaines races.

Le gène BMP15 est porté par le chromosome X. Il conduit à un fort taux d’ovulation à l’état hétérozygote et à la stérilité à l’état homozygote.

Puce Illumina Agri Search, 54K & LD

La puce à ADN Agri Search permet d’étudier l’expression de plusieurs milliers de gènes spécifiques aux races ovines.

Elle intègre les marqueurs nécessaires à l’assignation de parenté des animaux.
Elle permet d’étudier les gènes d’intérêt ovin.

L’ensemble du screening génétique peut également être utilisé pour le calcul d’index.

Aveyron Labo est partenaire de l’institut de l’Elevage pour la mise en place de la future plateforme OVIGEN.